拡張子をexeからscrに変えるとapp.configが正常に動かないのですが・・・

バージョンはVisualBasic.NET 2003です。
実行ファイル(*.exe)とともにapp.config(*.exe.config)を同階層のフォルダに置いてあるという状況です。
exeだと正常に動作するのですが、scrに拡張子を変えると
「"〜"がappSettingsセクションに見つかりません」みたいなメッセージが出てエラーになってしまいます。何か対処法はありませんか？お願いします。
また、app.configを実行ファイルにまとめる方法はあるのでしょうか？

やっぱINI使ってみますｗ

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