Vc(mfc)のシリアライズ関数で保存したファイルをc#のコードで読み込むことはできるでしょうか？
特に以下の点が気になっています。
・CTypePtrList等のリストデータの読み込み
・C#のコードでのスキーマバージョンの認識
よろしくお願いします。
シリアライズされたデータは，その規約に従えばデシリアライズできます。
なので，「できるかどうか」に対する答えは「できる」です。
ただし，MFCによるバイナリシリアライズの結果に対するデシリアライズ手段を，
C#なり.NET Frameworkなりは標準で提供していません。
なので，デシリアライズするためのコードを自分で書く (or 探してくる) 必要があります。